A l'instar de Jean-Marie Le Pen, Kotoujansky est un adepte des thèses de Thierry Meyssan sur le 11-Septembre. En 2008, il avait envoyé par e-mail à 3000 « cadres politiques, sociaux et culturels de la France » une longue lettre ouverte développant la thèse d'un « complot intérieur » et renvoyant au site conspirationniste ReOpen911.
Le 4 février 2009, Jean Guisnel révélait sur le site du Point.fr que le géopoliticien Aymeric Chauprade, ancien directeur de campagne de Philippe de Villiers aux européennes de 2004, chroniqueur pour le Figaro et titulaire de la chaire de géopolitique du Collège interarmées de défense, affichait des conceptions pour le moins contestables concernant les attentats […]